Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CRY2Q49AN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRY2Q49AN0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms