Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC153Q494R4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms