Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF260Q3ZCT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF260Q3ZCT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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