Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS9Q3SYG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS9Q3SYG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms