Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT71Q3SY84 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms