Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSGA10IPQ3SY00 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSGA10IPQ3SY00 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSGA10IPQ3SY00 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSGA10IPQ3SY00 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSGA10IPQ3SY00 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSGA10IPQ3SY00 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms