Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms