Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms