Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TXNRD1Q16881 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TXNRD1Q16881 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TXNRD1Q16881 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
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