Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HIST3H3Q16695 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIST3H3Q16695 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms