Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FSCN1Q16658 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSCN1Q16658 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms