Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM1Q16610 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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