Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN1Q16512 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
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