Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSX1Q16384 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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