Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA4Q16363 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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