Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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