Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETFDHQ16134 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETFDHQ16134 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms