Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP6AP1Q15904 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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