Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERC1Q15751 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HERC1Q15751 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms