Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1AQ15573 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1AQ15573 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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