Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF11Q15544 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF11Q15544 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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