Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PUM3Q15397 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUM3Q15397 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PUM3Q15397 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
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