Protein–RNA interactions for Protein: Q15375

EPHA7, Ephrin type-A receptor 7, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA7Q15375 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHA7Q15375 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHA7Q15375 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHA7Q15375 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms