Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRKQ15262 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRKQ15262 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRKQ15262 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
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