Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCF4Q15080 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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