Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCAPD2Q15021 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPD2Q15021 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPD2Q15021 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPD2Q15021 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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