Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMPD4Q14CM0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMPD4Q14CM0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms