Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMCO1Q147U7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMCO1Q147U7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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