Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1DQ13901 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1DQ13901 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1DQ13901 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1DQ13901 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1DQ13901 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1DQ13901 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1DQ13901 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C1DQ13901 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C1DQ13901 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C1DQ13901 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
C1DQ13901 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C1DQ13901 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1DQ13901 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1DQ13901 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms