Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALCAMQ13740 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALCAMQ13740 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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