Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FHL3Q13643 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FHL3Q13643 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FHL3Q13643 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FHL3Q13643 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FHL3Q13643 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FHL3Q13643 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FHL3Q13643 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FHL3Q13643 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FHL3Q13643 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FHL3Q13643 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FHL3Q13643 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FHL3Q13643 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms