Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATRQ13535 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATRQ13535 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATRQ13535 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATRQ13535 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRQ13535 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATRQ13535 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATRQ13535 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATRQ13535 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
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