Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1H3Q13133 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1H3Q13133 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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