Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPS1Q13098 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPS1Q13098 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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