Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1EQ12965 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms