Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IFRD2Q12894 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFRD2Q12894 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFRD2Q12894 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFRD2Q12894 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFRD2Q12894 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms