Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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TP53BP1Q12888 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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TP53BP1Q12888 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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TP53BP1Q12888 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TP53BP1Q12888 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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TP53BP1Q12888 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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TP53BP1Q12888 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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TP53BP1Q12888 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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TP53BP1Q12888 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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TP53BP1Q12888 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TP53BP1Q12888 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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