Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFEMP1Q12805 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFEMP1Q12805 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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