Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNMA1Q12791 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMA1Q12791 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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