Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPQ12770 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAPQ12770 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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