Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms