Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM1Q08AH1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms