Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSC1Q08554 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSC1Q08554 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSC1Q08554 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms