Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4BQ07343 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4BQ07343 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 463.5 ms