Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK18Q07002 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms