Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNDQ07001 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNDQ07001 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms