Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EN1Q05925 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EN1Q05925 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EN1Q05925 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EN1Q05925 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EN1Q05925 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EN1Q05925 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EN1Q05925 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EN1Q05925 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EN1Q05925 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EN1Q05925 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EN1Q05925 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EN1Q05925 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EN1Q05925 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EN1Q05925 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EN1Q05925 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EN1Q05925 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EN1Q05925 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EN1Q05925 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EN1Q05925 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EN1Q05925 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
EN1Q05925 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EN1Q05925 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EN1Q05925 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EN1Q05925 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EN1Q05925 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EN1Q05925 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EN1Q05925 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EN1Q05925 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EN1Q05925 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms