Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN12Q05209 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN12Q05209 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms