Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSTF1Q05048 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms