Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID5AQ03989 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID5AQ03989 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms